Orgue initialement construit par Aristide Cavaillé-Coll dans la cathédrale fraîchement achevée. Il est situé dans les hauteurs du bas-côté nord, à côté du chœur. 

À partir de 2024, l'instrument est reconstruit en repensant sa disposition sonore et physique da s l'édifice. 

Présence d'une façade, ajoutée par Cavaillé-Coll après l'achèvement de l'instrument, donnant sur le bas-côté Sud (liturgique, la cathédrale a son autel à l'ouest en réalité). La partie basse de celle-ci est ajourée et permettait d'y voir certains tuyaux de pédale ainsi que la boîte expressive du Positif.

À partir de 2026, l'instrument se trouve dispersé entre son emplacement originel, dans la chambre d'orgue au-dessus côté sud liturgique, dans quatre buffets dont deux dans les premières travées du chœur, et les deux autres dans les 2èmes travées de la nef. La chamade se trouve sous la verrière ouest, au bas de la nef. 
Les meubles sont en chêne, sur pilotis dans la nef, et sur soubassement dans le chœur. Dessin et ornements de style néogothique, dans l'esprit de la cathédrale (consacrée en 1886).

Deux consoles : 
Une console liturgique fixe, située dans le soubassement du Positif expressif, à gauche du chœur, de 4 claviers et pédalier, munie de tirants de registres dans l'esprit des consoles britanniques.
Une console "de concert" mobile, également à 4 claviers et pédalier, munie en revanche de dominos basculants modèle Klais, permettant de ne pas cacher la vue du musicien. Meuble en chêne de style néogothique.
Les deux consoles possèdent les mêmes fonctionnalités : plans sonores manuels (Grand-Orgue chœur, Positif expressif, Récit expressif chœur , Solo expressif I + Tuba Mirabilis, Solo expressif II, Grand-Orgue Nef, Récit expressif Nef et Chamade Nef) assignables (accouplables) à chacun des 4 claviers manuels en 16, 8, et 4, et à la Pédale en 8 et 4. Système intégré aux combinaisons.
Combinateur avec séquenceur et combinaisons divisionnelles (par clavier & au pédalier)
4 Crescendo programmables avec rouleau
4 pédales d'expression assignables librement aux 4 boîtes expressives
5 accouplements programmables
Gestion du système par écran tactile
Replay, Sostenuto + & -, MIDI in et out, ...

Deux consoles.

-Console principale indépendante. Elle est située au sol au bord du chœur, côté nord. L'organiste regarde en direction du chœur. Elle comporte 4 claviers manuels de 61 notes chacun. Tirants de registres disposés en colonnes de part et d'autres des claviers. Combinaisons disposées en fronton au dessus des claviers avec appels par dominos basculants.

- Combinateur Peterson MP 1000

Pédalier de 32 notes droit à l'allemande et incurvé. Au dessus, les champignons de combinaisons sont disposés sur trois niveaux (Combinaisons également appelables par dominos basculants). Au milieu, quatre pédales à bascule pour l'expression Positif, Récit et Solo, ainsi que pour le crescendo.

-La console du Grand Chœur se situe sur la tribune en fond de nef. Console indépendante et retournée. L'organiste regarde en direction du chœur. Elle comporte un seul clavier manuel de 61 notes. Tirants de registres disposés en fronton au dessus du clavier. Pédalier droit à l'allemande de 20 notes en tirasse permanente sur le manuel.   

Sommiers à registres et à tirage électropneumatique pour les notes. Quelques sommiers "unit" pour les basses, les façades, et certains jeux étendus ou empruntés.

Electrique. Transmissions des notes électrique et électro-pneumatique

Numérique.

Tempérament légèrement inégal (De Vos-Thomas)

440 Hz à 18°C

GO, Récit & Pédale Nef : un soufflet parallèle à un pli rentrant pour chaque buffet, alimentés par un ventilateur chacun.
Chamade Nef : deux soufflets parallèles à un pli rentrant, l'un pour la chamade, l'autre pour les basses en bois, alimentés par un ventilateur.
GO et Positif Chœur : dans chaque buffet, un ventilateur alimente un soufflet primaire à charge flottante qui alimente deux soufflets à un pli rentrant (l'un pour les basses, l'autre pour les dessus).

Soufflerie "à l'américaine" avec des soufflets à tables parallèles et à un pli rentrant, mis sous pression par ressorts reliant les deux tables. Plusieurs pressions sur l'ensemble de l'instrument.

Tuyauterie de Cavaillé-Coll, Mutin-Cavaillé-Coll, Cavaillé-Coll-Convers, Beuchet-Debierre, et neuve de Thomas & Klais.

La tuyauterie historique a été restaurée dans le respect du style, et la tuyauterie neuve a été construite dans l'esprit du nouveau concept musical, (re)centré sur Cavaillé-Coll. Les tuyaux sont soit coupés au ton, soit accordés avec des expressions.